Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREMQ03060 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREMQ03060 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREMQ03060 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREMQ03060 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREMQ03060 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREMQ03060 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CREMQ03060 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CREMQ03060 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms