Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 NLRP7-206ENST00000588756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CBX1P83916 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 NSUN4-204ENST00000474844 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 OLFML2B-201ENST00000294794 3160 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 KIF28P-202ENST00000504864 3064 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CBX1P83916 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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