Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
ACTA1P68133 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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