Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCL23P55773 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCL23P55773 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms