Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EPHB4P54760 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms