Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
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