Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ME1P48163 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ME1P48163 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ME1P48163 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ME1P48163 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ME1P48163 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms