Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACADSBP45954 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms