Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR1P43307 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR1P43307 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR1P43307 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR1P43307 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR1P43307 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR1P43307 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR1P43307 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR1P43307 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSR1P43307 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSR1P43307 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSR1P43307 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSR1P43307 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSR1P43307 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSR1P43307 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSR1P43307 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSR1P43307 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSR1P43307 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSR1P43307 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSR1P43307 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSR1P43307 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSR1P43307 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSR1P43307 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSR1P43307 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSR1P43307 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSR1P43307 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SSR1P43307 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms