Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
APOBEC1P41238 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms