Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRKCHP24723 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRKCHP24723 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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PRKCHP24723 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
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PRKCHP24723 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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PRKCHP24723 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRKCHP24723 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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