Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC9A1P19634 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms