Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ESRRAP11474 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms