Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TOP2AP11388 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TOP2AP11388 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms