Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRCH4O75427 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRCH4O75427 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRCH4O75427 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRCH4O75427 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRCH4O75427 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRCH4O75427 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRCH4O75427 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRCH4O75427 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LRCH4O75427 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRCH4O75427 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRCH4O75427 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRCH4O75427 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRCH4O75427 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRCH4O75427 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRCH4O75427 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRCH4O75427 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRCH4O75427 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRCH4O75427 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LRCH4O75427 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LRCH4O75427 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRCH4O75427 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms