Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MTMR11A4FU01 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms