Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
YBX2Q9Y2T7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms