Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB6

LIMA1, LIM domain and actin-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMA1Q9UHB6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIMA1Q9UHB6 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms