Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
COPS7AQ9UBW8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms