Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PPARGC1AQ9UBK2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms