Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DNMT3BQ9UBC3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms