Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARHGAP28Q9P2N2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARHGAP28Q9P2N2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms