Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms