Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms