Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf88Q9BSF0 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf88Q9BSF0 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf88Q9BSF0 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
C2orf88Q9BSF0 ZMYM5-201ENST00000337963 3268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 DNAI2-202ENST00000446837 2474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 AC010969.1-201ENST00000340444 2412 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 AC133065.6-201ENST00000625054 2378 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 HPGD-214ENST00000542498 2786 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 CYTH1-210ENST00000589297 3756 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 ANKDD1A-201ENST00000319580 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 ACOX3-201ENST00000356406 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
C2orf88Q9BSF0 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms