Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM43Q96BQ3 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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