Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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GTF3C6Q969F1 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF3C6Q969F1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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