Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARRDC4Q8NCT1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms