Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RUFY3Q7L099 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms