Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SPOCD1Q6ZMY3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms