Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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CDKN3Q16667 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
CDKN3Q16667 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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