Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SIX1Q15475 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SIX1Q15475 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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SIX1Q15475 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SIX1Q15475 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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