Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARHGEF6Q15052 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms