Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 AP001981.1-201ENST00000531132 738 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LAPTM4AQ15012 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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