Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPRHQ149N8 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SHPRHQ149N8 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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