Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RFTN1Q14699 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms