Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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TRIM25Q14258 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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TRIM25Q14258 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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TRIM25Q14258 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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TRIM25Q14258 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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TRIM25Q14258 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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TRIM25Q14258 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
TRIM25Q14258 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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