Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
FHL3Q13643 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms