Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
LSAMPQ13449 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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