Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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