Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUCB1Q02818 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NUCB1Q02818 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms