Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NHLH2Q02577 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms