Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TUBB4BP68371 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TUBB4BP68371 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms