Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CENPFP49454 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CENPFP49454 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CENPFP49454 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CENPFP49454 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CENPFP49454 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CENPFP49454 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CENPFP49454 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CENPFP49454 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CENPFP49454 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CENPFP49454 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CENPFP49454 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CENPFP49454 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CENPFP49454 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CENPFP49454 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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