Protein–RNA interactions for Protein: P46531

NOTCH1, Neurogenic locus notch homolog protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH1P46531 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NOTCH1P46531 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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