Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 LINC00894-206ENST00000450989 2361 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CDKN1BP46527 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms