Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GCAP28676 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GCAP28676 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GCAP28676 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms