Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PTPREP23469 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPREP23469 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPREP23469 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPREP23469 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPREP23469 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPREP23469 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPREP23469 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPREP23469 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPREP23469 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPREP23469 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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