Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC9A1P19634 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms