Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM21P19474 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms